第二階段將與醫療單位建立合作聯盟，發展成為質子治療中心，也是錫安生技質子癌症治療系統的營運試點基地。

錫安生技定位為質子標靶癌症治療機的設備供應商，並推廣台灣癌症質子醫療中心的服務模式，成為領導全球癌症治療的新趨勢。